中山医学院历史悠久，其源头可追溯至1866年，一位美国传教士嘉约翰在博济医院内建成中国近代内地第一所西医学府——博济医学堂，开西医教育之先河，..先生于1886年在此习医。这所医学堂后来发展成为岭南大学医学院，而始建于1908年的光华医学堂（后发展成为广东光华医学院）和创建于1909年的广东公医学堂（后发展成为中山大学医学院），也是中山大学医科教育源头。
1953年，岭南大学医学院和中山大学医学院合并成立华南医学院，随后广东光华医学院也并入华南医学院。此后，华南医学院相继改名为广州医学院、中山医学院、中山医科大学，并成立中山医科大学基础医学院。在著名医学教育家柯麟的带领下，中山医学院积极探索中国特色社会主义医学教育的发展模式和人才培养体系，汇集了一批在国内外医学界有较大影响力的大师和名家，如谢志光、梁伯强、陈耀真、陈心陶、林树模、秦光煜、钟世藩、周寿恺等国家一级教授。一代代名家大师筚路蓝缕，以启山林，率先垂范，实践力行，铸就中山医医病医身医心，救国救民救的大医济世精神，形成了三基三严的优良教学传统和基础厚、能力强、后劲足的人才培养中山医特色和优势，中山医学院成为了原卫生部直属的六所全国重点医学院校之一。
2001年10月，原中山大学与原中山医科大学合并组建成新的中山大学，并以基础医学院为主体，成立了新的中山医学院。合校后，中山医学院以大学为依托，继承和发扬了中山医的优良教学传统，坚持全球医学教育标准和德才兼备、领袖气质、家国情怀的人才培养目标，实施卓越医师培养计划和国际化办学战略，教育质量一直稳居国内前列，在国内外享有广泛的社会声誉。
中山大学中山眼科中心在中国眼科专科声誉连续13年排名第一、中国眼科科技影响力连续10年排名第一，是唯一的眼科学国家重点实验室依托单位。
中山眼科中心是眼科学国家创新高地。在眼科再生医学、生物信息、医学人工智能等做出了具有世界影响的贡献：利用内源性干细胞原位再生组织晶状体，2016年发表在Nature，并被Nature Medicine评为同年“全球医学八大进展之一”，这是我国医学界首次获评；创新眼科人工智能的临床应用；原研白内障的I类新药以13.8亿元实现转化。获11项国家科技进步奖（第一完成单位）。
中山眼科中心是我国最大的眼科人才培养基地（图4）。是第一批博士/硕士学位（眼科学）授权点、首批国家级眼科学继续教育基地。提出了培养人才的新理念（Lancet 2016），为国家培养了眼科领域最多的博士、硕士研究生（1177名）、进修生4950名；其中12人成为三甲医院院长，276人成为三甲医院眼科主任，还有眼科全国各省主委50人等学术骨干。
2024年，中山大学眼科中心计划招收61名硕士生，其中学硕29人，专硕32人。2024年，中山大学眼科中心博士招收计划是70人。
2022年医科院排行榜，广东医科大学排名59
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